به موجب این قانون، یگان حفاظت گمركهای كشور زیر نظر رئیس كل گمرك جمهوری اسلامی ایران برای حفاظت اماكن گمركی و كالاهای موجود در آنها و امور اجرائی مبارزه با قاچاق در محدوده آن اماكن با اخذ مجوز از ستاد كل نیروهای مسلح، تشكیل و مأموران آن در حدود وظایف و با شرایط مذكور در قانون آئین دادرسی كیفری ضابط خاص دادگستری محسوب می شوند.
تبصره ۱(اصلاحی ۱۴۰۰/۱۱/۱۰) - رئیس یگان حفاظت گمركهای كشور به پیشنهاد رئیس كل گمرك جمهوری اسلامی ایران پس از تأیید فرمانده نیروی انتظامی و با حكم ستاد كل نیروهای مسلح منصوب می شود.
تبصره ۲(اصلاحی ۱۴۰۰/۱۱/۱۰) - نحوه تسلیح نیروی یگان حفاظت گمرك های كشور و پاسگان (گارد) سازمان بنادر و دریانوردی به موجب دستورالعملی است كه توسط نیروی انتظامی جمهوری اسلامی ایران تهیه می شود و به تصویب ستاد كل نیروهای مسلح می رسد. نحوه حمل و به كارگیری سلاح توسط آنان تابع قانون به كارگیری سلاح توسط مأمورین نیروهای مسلح در موارد ضروری، مصوب ۱۳۷۳/۱۰/۱۸ است.
تبصره ۳(الحاقی ۱۴۰۰/۱۱/۱۰) - نیروهای پاسگان (گارد) سازمان بنادر و دریانوردی برای حفاظت از بنادر و محوطه های بندری به غیر از امور اجرائی مبارزه با قاچاق كالا و ارز كه در حیطه وظایف یگان حفاظت گمرك های كشور میباشد با رعایت شرایط مقرر در قانون آیین دادرسی كیفری مصوب ۱۳۹۲/۱۲/۰۴ با اصلاحات و الحاقات بعدی، ضابط خاص دادگستری محسوب می شوند.