وظایف قاضی اجرای احكام كیفری عبارت است از:
الف- صدور دستور اجرای احكام لازم الاجرای كیفری و نظارت بر شیوهی اجرای آنها
ب- نظارت بر زندان ها در امور راجع به زندانیان
پ- اعلام نظر درباره زندانیان واجد شرایط عفو و آزادی مشروط مطابق قوانین و مقررات
ت - اعطای مرخصی به محكومان بر اساس قوانین و مقررات
ث - اتخاذ تصمیم درباره محكومان سالمند، مبتلایان به بیماری های روانی و بیماریهای جسمی صعب العلاج و سایر افراد محكوم نیازمند به مراقبت و توجه ویژه، از قبیل صدور اجازه بستری برای آنها در مراكز درمانی بر اساس ضوابط و مقررات
ج- اجرای سایر وظایفی كه به موجب قوانین و مقررات برای اجرای مجازات ها وضع شده یا بر عهده قاضی اجرای احكام كیفری یا ناظر زندان قرار گرفته است.